More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1160 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
383 aa  779    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  31.44 
 
 
391 aa  172  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
396 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  27.81 
 
 
393 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
385 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
390 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
406 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  35.74 
 
 
394 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  32.34 
 
 
404 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
389 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
389 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.68 
 
 
415 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
397 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
394 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
395 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
379 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
395 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  24.48 
 
 
359 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
384 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
400 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
376 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
379 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
419 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
384 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
399 aa  95.9  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.07 
 
 
398 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.07 
 
 
398 aa  95.5  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
417 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 
385 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  26.72 
 
 
364 aa  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13881  hypothetical protein  26.8 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.812309  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
388 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
414 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  24.76 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  26.3 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.95 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 
410 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2884  a-glycosyltransferase  23.84 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0290347  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  20.37 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  23.1 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.19 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  33.33 
 
 
935 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  26.87 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
396 aa  77  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.93 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.42 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.06 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0985  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
435 aa  72.8  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>