More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3183 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
385 aa  800    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  60.27 
 
 
404 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  58.38 
 
 
406 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  59.32 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  44.81 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  50.13 
 
 
395 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  43.61 
 
 
400 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.81 
 
 
383 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  31.25 
 
 
415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
378 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.79 
 
 
393 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
390 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
395 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  29.21 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
388 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
389 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
396 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.61 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.61 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
399 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
394 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
384 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
400 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
402 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  26.38 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  32.93 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.37 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.33 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  22.02 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
411 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  36.07 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  27 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.43 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  30.05 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  22.4 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1146  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00446094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  31.41 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
800 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  22.04 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
422 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
476 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3893  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  29.51 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
405 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
423 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 
1039 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
439 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
439 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>