More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2550 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
384 aa  786    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
379 aa  201  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
389 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
396 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  28.79 
 
 
391 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 
398 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 
398 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
388 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  29.31 
 
 
393 aa  139  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  28.91 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.01 
 
 
415 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
390 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.05 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
395 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
406 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
384 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  24.23 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13881  hypothetical protein  29.24 
 
 
364 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.812309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
384 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
397 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
394 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
382 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  24.54 
 
 
359 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
385 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
376 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
402 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  24.21 
 
 
392 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
379 aa  89  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3025  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
389 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
376 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
536 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2434  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0597525  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2884  a-glycosyltransferase  22.01 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0290347  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.28 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
373 aa  77  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  28.7 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.83 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  24.8 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  25.21 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.75 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
398 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.75 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  23.18 
 
 
935 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.27 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>