More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3055 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
395 aa  777    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  79.74 
 
 
395 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  33.83 
 
 
415 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
388 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  30.03 
 
 
391 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.68 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.68 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.68 
 
 
393 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
399 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
390 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  32.41 
 
 
404 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
396 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.13 
 
 
392 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
389 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.15 
 
 
383 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
385 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
384 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
411 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
379 aa  123  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  22.47 
 
 
402 aa  123  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
417 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  25.88 
 
 
390 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
376 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
395 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
400 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
377 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
369 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
382 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
423 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  29.55 
 
 
382 aa  94.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.7 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
380 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
377 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.5 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
386 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
362 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
424 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
414 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6402  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.97 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
457 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.89 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30.15 
 
 
935 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
517 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.57 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  30.88 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.68 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  40.24 
 
 
467 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  32.08 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
425 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
434 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>