More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4093 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 378 aa  770    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 388 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  26.58 
 
 		 391 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 		 398 aa  125  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.21 
 
 		 398 aa  125  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  28.94 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  29.72 
 
 		 404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  25.69 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13881  hypothetical protein  25.14 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.812309  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  25.13 
 
 		 393 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  26.29 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 363 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  24.65 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.77 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.54 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  24.05 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 800 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0384  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  31.28 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  21.89 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.24 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.89 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  25.42 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.21 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  29.63 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3025  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 389 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  39.23 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0159  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.66 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  19.9 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.84 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  35.46 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  27.56 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  22.61 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  31.72 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>