More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8172 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
356 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  40.82 
 
 
347 aa  248  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  47.58 
 
 
350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  42.57 
 
 
349 aa  238  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  40.94 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  42.9 
 
 
347 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  41.01 
 
 
381 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
349 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  46.38 
 
 
350 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  42.17 
 
 
346 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  42.32 
 
 
347 aa  202  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  43.98 
 
 
357 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  40.13 
 
 
344 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  39.94 
 
 
344 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 
639 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
337 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
303 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 
343 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
349 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0797  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
360 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
457 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
351 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
458 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0644  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
380 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
360 aa  99.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
467 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
432 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  42.59 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  39.26 
 
 
417 aa  93.6  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  40.22 
 
 
370 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 
373 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  43.12 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
437 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
409 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
384 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
364 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
440 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 
426 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  41.4 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
423 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
386 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
384 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
408 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
408 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
408 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
452 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.04 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
440 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
743 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  35.02 
 
 
455 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
422 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
413 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
362 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  31.08 
 
 
374 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
390 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
414 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
419 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
426 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  36.87 
 
 
411 aa  85.9  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 
372 aa  85.9  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.9 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  29.21 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
448 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
421 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  43.05 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4585  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.78 
 
 
409 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 
426 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
407 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1076  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
672 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>