More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1110 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 419 aa  845    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  80.75 
 
 		 416 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  70.83 
 
 		 375 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 810 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  28.01 
 
 		 370 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  33.2 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 822 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  35.41 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 		 471 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  31.39 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.31 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 376 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  33.93 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0312  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.72 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  33.52 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  29.84 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  29.18 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 		 800 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  30.32 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 		 361 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  29 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  30.81 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 762 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  35.45 
 
 		 638 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.6 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28.51 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.08 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  29.13 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2416  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0844793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0966  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0155699  normal  0.836168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  31.61 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>