More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2416 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2416  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
391 aa  814    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0844793  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5786  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0889  a-glycosyltransferase  30.35 
 
 
365 aa  116  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0344905  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0842  glycosyl transferase, group 1  35.52 
 
 
393 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.075779  hitchhiker  0.00456148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
439 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
439 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
439 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02458  Glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
365 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.772087  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  31.56 
 
 
400 aa  86.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
438 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 
438 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
419 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.28 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
495 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.78 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
499 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
498 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  30.87 
 
 
360 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  35.09 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  34.84 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  32.76 
 
 
393 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1187  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
461 aa  69.7  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
450 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
507 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  30.18 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  29.61 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  34.93 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
820 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  32.34 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  35.57 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  28.26 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>