More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02458 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02458  Glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
365 aa  758    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.772087  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0842  glycosyl transferase, group 1  47.37 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.075779  hitchhiker  0.00456148 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
357 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
348 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2416  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 
391 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0844793  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.62 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5786  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  28.02 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  29.09 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
812 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  33.77 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.53 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  33.13 
 
 
816 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  32.04 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0811  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
810 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.99 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3874  putative glycosyltransferase  28.23 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59519  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  30.66 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
819 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  28.36 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  26.25 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  25.42 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  28.14 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  30.67 
 
 
426 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  30.4 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
385 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
431 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3037  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.479562  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  31.82 
 
 
403 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
357 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  25.6 
 
 
350 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  31.54 
 
 
397 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
816 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
369 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
402 aa  63.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  25.67 
 
 
350 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
750 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
417 aa  63.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
739 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
402 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1141  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.85 
 
 
397 aa  62.8  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
416 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
377 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>