More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0373 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 386 aa  774    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  40.94 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  39.94 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  39.41 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 369 aa  216  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  29.78 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  29.29 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.87 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  32.28 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 408 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  29.2 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 403 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  29.01 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  29.01 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.93 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.27 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  33.42 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.9 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  27.62 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  27.62 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.62 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 374 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.8 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.8 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.35 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  31.6 
 
 		 400 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.78 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  26.06 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  29.01 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  25.71 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 381 aa  95.9  9e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.42 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1402  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.33 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  24.16 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 390 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  26.58 
 
 		 442 aa  92.8  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  26.43 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.18 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 419 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 		 536 aa  89.7  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  32 
 
 		 386 aa  89.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 		 394 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 		 394 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 378 aa  89.7  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 394 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  27.47 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  29.19 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>