More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0402 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 380 aa  744    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  63.78 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  62.73 
 
 		 386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  62.47 
 
 		 386 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  62.3 
 
 		 386 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  61.42 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  61.73 
 
 		 387 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  61.11 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  46.24 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  45.43 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  44.03 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 		 455 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  39.79 
 
 		 499 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  40 
 
 		 440 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 		 565 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  35.92 
 
 		 448 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 		 518 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 		 361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  35.9 
 
 		 425 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 		 468 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  36.77 
 
 		 605 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 348 aa  137  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 370 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0156  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 		 353 aa  96.7  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  35.44 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.16 
 
 		 935 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 371 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  37.58 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 507 aa  79.7  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  39.91 
 
 		 405 aa  79.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  21.47 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  32.76 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25.89 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 426 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 770 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  32.35 
 
 		 367 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>