More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0483 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
370 aa  754    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  39.12 
 
 
361 aa  242  6e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
353 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
445 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
386 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
386 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
518 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
388 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
384 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
565 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0156  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
359 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
386 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  31.18 
 
 
384 aa  136  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  27.47 
 
 
448 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
349 aa  126  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  29.08 
 
 
425 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  31.12 
 
 
440 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
605 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.36 
 
 
373 aa  105  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
468 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
361 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.62 
 
 
388 aa  96.3  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
822 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
380 aa  92.8  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  27.18 
 
 
389 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
355 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
363 aa  89.7  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
393 aa  89.4  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
360 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
381 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  24.62 
 
 
935 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  26.22 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.6 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 
800 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.79 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0377  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778266  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.79 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.79 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  24.11 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
838 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
536 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.79 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.79 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.79 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.84 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.79 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.53 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.79 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.79 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  27.49 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.91 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  27.52 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>