More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4957 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
518 aa  994    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  50.62 
 
 
565 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  45.93 
 
 
499 aa  309  8e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  49.17 
 
 
605 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  48.22 
 
 
392 aa  289  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  45 
 
 
388 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  45.21 
 
 
448 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  42.62 
 
 
425 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  44.99 
 
 
440 aa  257  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  39.43 
 
 
386 aa  200  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  35.15 
 
 
361 aa  197  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  39.14 
 
 
386 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  37.47 
 
 
398 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
393 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  36.87 
 
 
384 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 
380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  42.09 
 
 
384 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 
386 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 
455 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 
386 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
360 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
387 aa  159  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
370 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
353 aa  149  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
348 aa  126  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0156  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
359 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
409 aa  87.8  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
370 aa  87  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  28.07 
 
 
389 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
476 aa  86.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
536 aa  82.4  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  35.61 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.41 
 
 
769 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
366 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
394 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02330  transferase, putative  30.77 
 
 
783 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
395 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  37.17 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  41.55 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  40.26 
 
 
372 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.12 
 
 
377 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
353 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  35.52 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
822 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  31.22 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  38.33 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
416 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  42.54 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  28.02 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  38.03 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  33.33 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
393 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
351 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
364 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
904 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 
704 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  28.49 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  29.48 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  28.49 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.18 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3395  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 
1267 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.18 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.18 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.46 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>