More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2254 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
358 aa  730    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  77.93 
 
 
358 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06720  glycosyltransferase  56.18 
 
 
398 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0367978  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
361 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
381 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
1229 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5473  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
375 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  28.99 
 
 
353 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
369 aa  86.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  27.37 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.13 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  24 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  24 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.18 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  23.69 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.89 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7046  putative glycosyltransferase  31.98 
 
 
473 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.378884  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1060  putative glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.762767  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  24 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  23.48 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  31.55 
 
 
460 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  23.48 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2892  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5391  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
1261 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
376 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  30.36 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  29.83 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4549  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
672 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643981  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
1398 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  28.01 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1413  mannosyltransferase  26.17 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.953806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4295  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0106355  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
1241 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  27.33 
 
 
743 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  37.07 
 
 
1635 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
1241 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  28.26 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01121  hypothetical protein  25.93 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
499 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  26.36 
 
 
846 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
846 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
452 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3290  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  27.54 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
1243 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  30.86 
 
 
859 aa  70.1  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  23.9 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>