More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3000 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
384 aa  767    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  47.98 
 
 
398 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  47.58 
 
 
393 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  46.07 
 
 
386 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  46.72 
 
 
386 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  47.97 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  46.19 
 
 
386 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  44.71 
 
 
386 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  44.03 
 
 
380 aa  295  7e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  45.83 
 
 
360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  44.32 
 
 
384 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 
455 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  42.09 
 
 
518 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 
445 aa  205  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 
392 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
388 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
565 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 
361 aa  173  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  35.54 
 
 
448 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
370 aa  170  5e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 
605 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  36.19 
 
 
425 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  37.97 
 
 
440 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
499 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
348 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0156  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
349 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  26.86 
 
 
389 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
380 aa  89.7  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
476 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
415 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.31 
 
 
410 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4022  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  36.31 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  21.96 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.25 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  38.35 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
810 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  33.48 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
376 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  38.35 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  20.31 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
452 aa  77  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  32.75 
 
 
935 aa  76.6  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
770 aa  76.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3184  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.76 
 
 
536 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.32 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  30.23 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  28.93 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.18 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1459  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00514335  hitchhiker  0.00279802 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.55 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
448 aa  72.8  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
398 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  33.13 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.3 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.3 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
361 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
748 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.43 
 
 
431 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.43 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>