More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0230 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
499 aa  952    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  45.71 
 
 
518 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  42.61 
 
 
392 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  44.8 
 
 
565 aa  256  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  40.43 
 
 
448 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  43.51 
 
 
440 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  41.64 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  40.39 
 
 
425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  40.12 
 
 
605 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 
468 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  39.79 
 
 
380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 
361 aa  194  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 
386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  36.75 
 
 
386 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
370 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
386 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
387 aa  170  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
445 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 
360 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  34.38 
 
 
384 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
398 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
393 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
353 aa  140  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 
384 aa  140  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
348 aa  123  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
360 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
390 aa  87.4  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
446 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
370 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.58 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0156  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
536 aa  79.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.4 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  34.85 
 
 
398 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.85 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
427 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  22.68 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.36 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.89 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.68 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.36 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  41.52 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.68 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  23.68 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  23.68 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.68 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  23.68 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  28.42 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
377 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 
395 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
386 aa  73.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  35.63 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2710  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
367 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.395873  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
904 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.49 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.88 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  35.42 
 
 
822 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1223  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>