More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0894 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
381 aa  780    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
419 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
416 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
390 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
365 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  30.21 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
377 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
430 aa  90.1  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
370 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
389 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
377 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.83 
 
 
346 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
376 aa  86.7  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.73 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
756 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1694  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  40.49 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0632  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.26 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  25.72 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  26.24 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  25.15 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13801  hypothetical protein  31.56 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.8447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
421 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0759  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  30.91 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4421  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.19 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  28.44 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
810 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30.28 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.76 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  26.01 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  30.28 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
930 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.64 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  25.25 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  26.78 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.93 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>