More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3637 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
756 aa  1507    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  74.67 
 
 
773 aa  1065    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
744 aa  359  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  45.33 
 
 
478 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4094  glycosyl transferase, group 1  46.21 
 
 
468 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537371  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
1177 aa  230  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
1177 aa  230  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 
382 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
543 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 
334 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 
322 aa  127  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 
261 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 
421 aa  111  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
260 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
777 aa  110  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1181  glycosyltransferase, group 1 family protein  26.3 
 
 
579 aa  110  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  32.4 
 
 
272 aa  109  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
321 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
1032 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
318 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
261 aa  105  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 
278 aa  104  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
384 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  35.77 
 
 
388 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.42 
 
 
642 aa  102  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  33.62 
 
 
398 aa  101  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
350 aa  101  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
316 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
738 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
253 aa  98.2  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
387 aa  98.2  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
327 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  36.74 
 
 
374 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  29.74 
 
 
382 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  29.74 
 
 
382 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
324 aa  94.4  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
663 aa  94.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.84 
 
 
341 aa  94.4  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
323 aa  93.6  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
689 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
373 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  34.2 
 
 
382 aa  94  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
268 aa  93.2  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
336 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  39.11 
 
 
318 aa  92.4  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
1015 aa  92  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.24 
 
 
407 aa  92  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
303 aa  91.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
388 aa  91.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
399 aa  91.7  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
393 aa  91.3  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
305 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  31.33 
 
 
397 aa  90.9  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1421  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
399 aa  90.9  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
2046 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
377 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.65 
 
 
295 aa  89.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
337 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  34.22 
 
 
382 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
414 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 
415 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
372 aa  90.1  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  33.19 
 
 
387 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
314 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  36.11 
 
 
287 aa  89  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
299 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
305 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
386 aa  88.6  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  33.82 
 
 
423 aa  88.6  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  30.46 
 
 
311 aa  88.2  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
379 aa  88.2  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
398 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
289 aa  88.2  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
337 aa  88.2  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
302 aa  87.8  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
344 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  28.8 
 
 
399 aa  87.8  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
330 aa  87.8  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
378 aa  87.8  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
376 aa  87.8  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  37.16 
 
 
401 aa  87.8  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
369 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
361 aa  87.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  32.45 
 
 
255 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
352 aa  87  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
333 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
398 aa  87  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
316 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
389 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  24.87 
 
 
377 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
387 aa  86.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
336 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
399 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.86 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.43 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>