More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0769 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 352 aa  727    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  33.19 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.93 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  31.12 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 777 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 299 aa  99.4  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.96 
 
 		 642 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.5 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 		 337 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 		 289 aa  96.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 313 aa  96.7  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 272 aa  96.7  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 397 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 318 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 660 aa  95.9  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 317 aa  95.9  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 1032 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  38.06 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 428 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 544 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 581 aa  91.3  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.66 
 
 		 957 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 235 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.12 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 1250 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 303 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 		 294 aa  89.4  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.23 
 
 		 314 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.34 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  31.05 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  26.78 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  24.06 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 		 268 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 773 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.87 
 
 		 1099 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.22 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.33 
 
 		 321 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 746 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 1035 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 584 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 289 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 235 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.97 
 
 		 326 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.55 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  31.6 
 
 		 2046 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 573 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.97 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 1015 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 756 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.56 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.81 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 689 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  34.81 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.81 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.81 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  34.81 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 1739 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  38.17 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>