More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0383 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
329 aa  680    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  50.16 
 
 
325 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
318 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
318 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
310 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
336 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.44 
 
 
312 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
344 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
1035 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
313 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.26 
 
 
672 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.96 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
289 aa  90.5  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
352 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
324 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
330 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
581 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
294 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
317 aa  86.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
333 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
380 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 
295 aa  85.9  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.99 
 
 
327 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
305 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
333 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
597 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
306 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  29.28 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
727 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  34.1 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.99 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
1275 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
397 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  41.82 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
1177 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.72 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
1067 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
1177 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
1250 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
363 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
663 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.27 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  45.92 
 
 
347 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
544 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  41.18 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
880 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  37.27 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>