More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2652 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 290 aa  591  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  46.96 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 		 280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 324 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 		 345 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.86 
 
 		 295 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12951  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.98 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00175067  normal  0.0957676 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.59 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.49 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 1035 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 333 aa  106  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 398 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 338 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  26.61 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  29.06 
 
 		 255 aa  99.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 380 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 344 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 325 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  30.42 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.36 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 329 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 235 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 597 aa  95.9  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 386 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 329 aa  93.6  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 363 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 347 aa  92.8  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 347 aa  92.8  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 1250 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 727 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 337 aa  92  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.54 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.46 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  32.46 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.46 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 333 aa  89.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  30.91 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 		 266 aa  89.7  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.83 
 
 		 672 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.74 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  27.34 
 
 		 340 aa  89  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 373 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 334 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 455 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 336 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  33.16 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.84 
 
 		 341 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 		 390 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.72 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>