More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2244 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
324 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  53.48 
 
 
318 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  49.57 
 
 
847 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  39.79 
 
 
746 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
450 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  48.11 
 
 
581 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3705  glycosyl transferase family protein  41.11 
 
 
524 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459069  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  41.26 
 
 
641 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
321 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
390 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
597 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
312 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
318 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
318 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 
299 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
320 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
1032 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
337 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
305 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
305 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
1035 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
930 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.08 
 
 
321 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
280 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
1739 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
294 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
398 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.72 
 
 
341 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
295 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
344 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
386 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
336 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
314 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
373 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
310 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
1250 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
380 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
365 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
303 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
294 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
374 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
363 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
280 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
274 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.41 
 
 
367 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
231 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
774 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
276 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.18 
 
 
254 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
316 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
898 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  42.5 
 
 
379 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
334 aa  99.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
898 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
300 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
323 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  41.18 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
336 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
295 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
352 aa  99  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  29.82 
 
 
332 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.18 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
390 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
672 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  41.18 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
482 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
364 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
373 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
275 aa  96.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
1067 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  39.64 
 
 
326 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  29.52 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
244 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
280 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40.34 
 
 
326 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 
312 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.06 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>