More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3705 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3705  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 524 aa  1085    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  37.75 
 
 		 641 aa  249  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  41.05 
 
 		 847 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  44.64 
 
 		 318 aa  197  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.11 
 
 		 324 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 		 581 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 746 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 		 235 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 313 aa  118  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.19 
 
 		 312 aa  104  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 		 310 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 321 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 1032 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 318 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 672 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 299 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 331 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 344 aa  90.9  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 930 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 605 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 305 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 319 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 482 aa  89.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 774 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 898 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 898 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 230 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 268 aa  87.4  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  41.96 
 
 		 1035 aa  87.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 294 aa  87.4  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 294 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 324 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  28.76 
 
 		 299 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  27.78 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  38.66 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 333 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 327 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  42.57 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.73 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.49 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  44.79 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1594  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 		 283 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.27 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 289 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.57 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  30.94 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.97 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 597 aa  78.2  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 		 701 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.57 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 337 aa  76.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 321 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  32.21 
 
 		 349 aa  76.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>