More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1200 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
319 aa  637    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
330 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
325 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
299 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
320 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
265 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
301 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
300 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 
261 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
250 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
261 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
390 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
327 aa  99.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1411  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
292 aa  96.3  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  28.74 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 
310 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  22.69 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
235 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
247 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
344 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
974 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
374 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
703 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
605 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
455 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1837  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
350 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3705  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
524 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459069  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
597 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  23.38 
 
 
337 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  30.22 
 
 
308 aa  89.7  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
297 aa  89.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
983 aa  89.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
301 aa  89  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
326 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
847 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
291 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
386 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.93 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
363 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
254 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  22.55 
 
 
672 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
581 aa  87.4  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  27.05 
 
 
294 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.09 
 
 
312 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.69 
 
 
341 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
280 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
276 aa  87  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  28.38 
 
 
302 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
390 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.84 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  24.71 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
376 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  36.57 
 
 
746 aa  85.9  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.68 
 
 
326 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.53 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.68 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
701 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.9 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  25.79 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
331 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  25.2 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
609 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.08 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  22.98 
 
 
727 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.85 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  24.29 
 
 
302 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  27.13 
 
 
708 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>