More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3739 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
701 aa  1448    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  84.76 
 
 
271 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  45.74 
 
 
1562 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 
605 aa  244  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  48.5 
 
 
974 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  48.05 
 
 
285 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  42.62 
 
 
297 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
286 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
304 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 
718 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.05 
 
 
274 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
327 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2879  hypothetical protein  34.21 
 
 
323 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  38.86 
 
 
261 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  33.19 
 
 
342 aa  132  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0712  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 
307 aa  132  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
278 aa  130  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  40.09 
 
 
261 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
249 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 
265 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  36.06 
 
 
331 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
261 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0713  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
307 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
268 aa  125  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 
288 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
310 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
328 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
254 aa  117  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 
279 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
1037 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
296 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  35 
 
 
329 aa  114  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
295 aa  114  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  32.43 
 
 
325 aa  114  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
235 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3151  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
286 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  28.63 
 
 
318 aa  109  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
274 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
269 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.02 
 
 
312 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
269 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 
335 aa  99.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  43.75 
 
 
274 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
249 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.23 
 
 
295 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  46.24 
 
 
235 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  44.09 
 
 
302 aa  95.1  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 
853 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
249 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
257 aa  94.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 
293 aa  94.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
294 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
273 aa  92.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
294 aa  91.3  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
283 aa  90.5  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
249 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
299 aa  88.6  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.1 
 
 
853 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
252 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
847 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
746 aa  86.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
249 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.55 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  28.22 
 
 
272 aa  85.9  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1837  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 
350 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  39.56 
 
 
270 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
256 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  45.05 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.91 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
1032 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
244 aa  84  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  34.43 
 
 
267 aa  84  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
324 aa  84  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.66 
 
 
316 aa  83.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
258 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.44 
 
 
853 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
597 aa  82.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  31.37 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  28.19 
 
 
249 aa  82  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
266 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
358 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
336 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
337 aa  80.5  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
1177 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  27.19 
 
 
308 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 
1177 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
339 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  35.48 
 
 
708 aa  79  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
283 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>