More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2010 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
305 aa  634    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
321 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
303 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.54 
 
 
312 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  38.07 
 
 
323 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
318 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
310 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
313 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.77 
 
 
312 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
398 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
314 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
597 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.89 
 
 
672 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
324 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
235 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
302 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
299 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.88 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
330 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
320 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
333 aa  125  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.39 
 
 
310 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 
380 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
386 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
300 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.77 
 
 
373 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.88 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
450 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.12 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
318 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
581 aa  119  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
349 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
847 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.63 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.98 
 
 
324 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.63 
 
 
326 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.83 
 
 
326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
390 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
326 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
746 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
544 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
397 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
297 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
347 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
357 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
307 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
374 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
1035 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
335 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  28.72 
 
 
325 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
261 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
301 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
261 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
330 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
325 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
310 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.23 
 
 
314 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
350 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.64 
 
 
341 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  32.7 
 
 
309 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
317 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
1032 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.27 
 
 
317 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
274 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
352 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
337 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
230 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  31.9 
 
 
327 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
331 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 
367 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
327 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.47 
 
 
327 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  31.9 
 
 
327 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 
327 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 
327 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 
379 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
322 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
347 aa  99.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
233 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
342 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
857 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>