More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3254 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 314 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.61 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  34.39 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  36.49 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 672 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 320 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  32.87 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  34.83 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 233 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 689 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  51.61 
 
 		 326 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  46.67 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  51.61 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  50.54 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 1035 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 230 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 		 268 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  32.29 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  46.24 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 		 1015 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 544 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 1301 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  35.23 
 
 		 352 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 597 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 386 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  28.43 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  47.19 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.02 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 		 390 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.22 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 331 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  43.43 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  37.59 
 
 		 155 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  39.64 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  39.64 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  39.64 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  43.48 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  39.64 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  39.64 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  39.64 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  37.39 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  29.25 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  34.4 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  35.76 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  39.64 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  39.64 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  39.56 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>