More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1912 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
342 aa  701    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  72.46 
 
 
345 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  64.71 
 
 
324 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.28 
 
 
327 aa  299  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  47.93 
 
 
280 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.28 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
291 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
310 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 
302 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12951  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.03 
 
 
306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00175067  normal  0.0957676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
325 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
313 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.7 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
233 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
333 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.45 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
337 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
280 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
330 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
324 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
331 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
335 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  29.48 
 
 
255 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
318 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
597 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
316 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
347 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
327 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
322 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
1250 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
318 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
337 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  47.83 
 
 
230 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.77 
 
 
341 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
317 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.3 
 
 
312 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
327 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
235 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 
344 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
268 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
573 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
326 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
367 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
294 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
314 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
299 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
333 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
261 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.43 
 
 
367 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
300 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
334 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 
1035 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
374 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
289 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
321 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
249 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
351 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
278 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
347 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
289 aa  95.9  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
373 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.56 
 
 
466 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
746 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
704 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
326 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  29.58 
 
 
306 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.83 
 
 
324 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
308 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
760 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
398 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
354 aa  92.4  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 
244 aa  92.4  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  29.94 
 
 
309 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
280 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
262 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
301 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>