More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4316 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
450 aa  907    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  48.84 
 
 
847 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
318 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  38.35 
 
 
581 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.39 
 
 
324 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  39.59 
 
 
641 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3705  glycosyl transferase family protein  39.37 
 
 
524 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459069  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
746 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 
235 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.9 
 
 
312 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
299 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
1032 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
344 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
313 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.64 
 
 
321 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
289 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
597 aa  120  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.22 
 
 
295 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 
672 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 
302 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
300 aa  110  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
398 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.63 
 
 
312 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
321 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
310 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
294 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  37.75 
 
 
276 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
230 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
330 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
297 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
323 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
331 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
235 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
333 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
310 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
318 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
337 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
1035 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
320 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
295 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
324 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
347 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
930 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
1250 aa  103  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
341 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
336 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
334 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
750 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
544 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
292 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
812 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
311 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  36.2 
 
 
275 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
390 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
727 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 
321 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
261 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
294 aa  100  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
898 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
361 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
898 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
774 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
324 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
279 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
333 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  39.09 
 
 
326 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
333 aa  97.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.27 
 
 
341 aa  97.4  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
274 aa  97.8  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
303 aa  97.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
358 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 
379 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
256 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.63 
 
 
466 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
354 aa  96.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
352 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
324 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
363 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.78 
 
 
367 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
316 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
314 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
347 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
326 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
289 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 
253 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
301 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
373 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>