More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1381 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 326 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.8 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  40.7 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  39.59 
 
 		 1035 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  39.91 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  41.79 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  39.11 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  39.38 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  45.59 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  33 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  38.95 
 
 		 235 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  50.47 
 
 		 337 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 672 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  57.69 
 
 		 362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 746 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 597 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 		 235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  41.5 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  35.23 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  40.1 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  50.5 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  35.38 
 
 		 306 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  32.61 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 231 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  41.59 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  38 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.54 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.05 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  41.59 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 318 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 315 aa  99.8  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  45.19 
 
 		 326 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 1038 aa  99  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 		 704 aa  99  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  37.68 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40.71 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  47.87 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 		 1015 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 363 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 		 1032 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  41.41 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.3 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 		 450 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.33 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  48.89 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  42.86 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  26.15 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2822  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.17 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  30.83 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  43.24 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  49.54 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 268 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 291 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 581 aa  92.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  43 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>