More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3338 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
1250 aa  2607    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  44.33 
 
 
450 aa  363  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1927  cobalamin B12-binding domain protein  45.26 
 
 
288 aa  266  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2434  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  38.56 
 
 
1562 aa  208  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  42.06 
 
 
308 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 
470 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  31.85 
 
 
494 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  31.85 
 
 
494 aa  177  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 
494 aa  177  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 
494 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 
459 aa  170  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 
321 aa  168  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 
305 aa  167  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  39.57 
 
 
351 aa  166  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  33.06 
 
 
563 aa  164  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  38.29 
 
 
334 aa  163  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 
564 aa  162  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  38.46 
 
 
321 aa  160  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
347 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
361 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 
564 aa  157  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  41.77 
 
 
306 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 
489 aa  156  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  33.87 
 
 
554 aa  156  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  30.13 
 
 
459 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  31.83 
 
 
857 aa  151  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 
461 aa  151  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
280 aa  151  9e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 
469 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  28.23 
 
 
484 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  40.97 
 
 
327 aa  149  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  30.55 
 
 
444 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
322 aa  146  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  40.99 
 
 
341 aa  145  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
347 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.39 
 
 
466 aa  145  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  28.57 
 
 
548 aa  144  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 
488 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
353 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
367 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.98 
 
 
341 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
487 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
623 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
277 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.92 
 
 
957 aa  142  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 
441 aa  141  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.81 
 
 
441 aa  141  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
529 aa  141  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
274 aa  141  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 
426 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  31.16 
 
 
556 aa  140  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.75 
 
 
472 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
363 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.03 
 
 
472 aa  138  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
373 aa  137  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  29.53 
 
 
677 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
338 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 
472 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  35.05 
 
 
340 aa  135  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 
518 aa  135  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
1067 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
367 aa  134  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 
364 aa  134  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
318 aa  133  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  39.45 
 
 
352 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 
488 aa  134  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  27.48 
 
 
485 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  39.9 
 
 
365 aa  133  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
1275 aa  132  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  37.91 
 
 
336 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
458 aa  132  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
339 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
321 aa  131  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
1152 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  37.26 
 
 
336 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
1152 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 
723 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  34.91 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  39.52 
 
 
663 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  39.01 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  28.37 
 
 
501 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 
451 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  30.21 
 
 
512 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.98 
 
 
674 aa  128  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  33.33 
 
 
341 aa  128  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 
473 aa  128  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 
473 aa  128  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 
338 aa  127  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
398 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
294 aa  127  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 
302 aa  127  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 
336 aa  126  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  27.55 
 
 
548 aa  126  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
1035 aa  126  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
283 aa  125  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
318 aa  125  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
380 aa  125  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
337 aa  125  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 
503 aa  124  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>