More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2737 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
482 aa  954    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 
1032 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  39.91 
 
 
1739 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
450 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
299 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
641 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
812 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
847 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
318 aa  97.1  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.39 
 
 
324 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
295 aa  96.7  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  22.25 
 
 
365 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  33.03 
 
 
392 aa  94  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
302 aa  94  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
337 aa  93.6  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
333 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
597 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.64 
 
 
672 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0042  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
326 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0044  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
326 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
261 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
345 aa  90.9  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.5 
 
 
312 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
727 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.75 
 
 
254 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
305 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3705  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
524 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459069  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
746 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
235 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  46.39 
 
 
983 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
261 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  38.93 
 
 
1168 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
581 aa  87.8  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
261 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
326 aa  87  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
321 aa  86.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
318 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  41.6 
 
 
785 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
265 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2353  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.712246  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
1015 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  43.59 
 
 
324 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
276 aa  84  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  45.63 
 
 
672 aa  83.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  26.03 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
336 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
1038 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
350 aa  83.2  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  22.39 
 
 
372 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
314 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.7 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
1116 aa  82.4  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  36 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  44.79 
 
 
1169 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.23 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  45.63 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  23.53 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  33.63 
 
 
325 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  38.04 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  29.67 
 
 
309 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
209 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
249 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2601  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
272 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
544 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
300 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.4 
 
 
266 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
320 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
230 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  43.52 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  29.25 
 
 
306 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.16 
 
 
307 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  34.4 
 
 
266 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.4 
 
 
266 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
332 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 
333 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.09 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.35 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
774 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>