More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4593 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1032 aa  2093    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  42.53 
 
 
1739 aa  231  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 
482 aa  158  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.67 
 
 
396 aa  142  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
235 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
450 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
847 aa  128  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.25 
 
 
415 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.06 
 
 
324 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  34.41 
 
 
419 aa  126  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
309 aa  126  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 
420 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  33.6 
 
 
369 aa  125  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 
392 aa  125  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 
420 aa  124  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 
420 aa  124  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 
420 aa  124  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.71 
 
 
392 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.18 
 
 
420 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
344 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.78 
 
 
312 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
318 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
371 aa  121  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 
419 aa  119  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  38.64 
 
 
375 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
346 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
581 aa  115  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
1015 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 
359 aa  115  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
327 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
390 aa  114  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
313 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 
641 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
305 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
930 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
746 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
335 aa  112  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
321 aa  112  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  35.27 
 
 
616 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
399 aa  111  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.7 
 
 
295 aa  111  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
348 aa  110  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
324 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
318 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
316 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
330 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
420 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
398 aa  108  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  33.67 
 
 
341 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
299 aa  108  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
898 aa  108  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
898 aa  108  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.8 
 
 
351 aa  107  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
774 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
303 aa  107  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
276 aa  107  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
305 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  43.31 
 
 
350 aa  107  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  33.69 
 
 
361 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
310 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
372 aa  105  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.03 
 
 
300 aa  105  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
320 aa  105  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
361 aa  105  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
331 aa  105  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
324 aa  105  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
300 aa  105  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 
672 aa  104  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
325 aa  104  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
294 aa  104  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
302 aa  104  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
347 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
334 aa  103  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
247 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
379 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
597 aa  103  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
398 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
337 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
983 aa  102  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 
374 aa  102  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
302 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
280 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
333 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
309 aa  102  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
314 aa  102  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  33.69 
 
 
261 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  30.81 
 
 
272 aa  102  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  43.75 
 
 
343 aa  101  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
338 aa  101  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3705  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 
524 aa  101  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459069  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
356 aa  101  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
332 aa  101  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  33.69 
 
 
261 aa  101  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
363 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
318 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
261 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
396 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  45.36 
 
 
326 aa  100  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
302 aa  100  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
294 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>