More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1543 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  37.97 
 
 		 284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 320 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  39.62 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  39.9 
 
 		 249 aa  128  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  38.12 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  34.58 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.42 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.89 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1238  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28991 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  32.2 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  32.02 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  36.22 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 		 1032 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  43.65 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0852  glycosyl transferase family 2  40.44 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2772  b-glycosyltransferase  29.03 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  50.52 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 246 aa  98.2  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2669  putative glycosyl transferase  33.48 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.112255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 313 aa  95.5  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11548  hypothetical protein  35.68 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2451  putative glycosyl transferase  34.63 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.387011  normal  0.0134756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2344  putative glycosyl transferase  34.63 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.679221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2293  putative glycosyl transferase  34.62 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.56744  normal  0.0769014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2337  putative glycosyl transferase  34.63 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.444187 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2236  putative glycosyl transferase  34.15 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478482  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4785  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0671462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.51 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.05 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  31.71 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  32.51 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 286 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  46.15 
 
 		 342 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  42.7 
 
 		 296 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2972  WbdO  34.12 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354784  hitchhiker  0.000000078637 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  29.55 
 
 		 325 aa  85.5  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4765  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 269 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  31.53 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  32.37 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  42.42 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  32.37 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  44.09 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  31.58 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  31.71 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 1739 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.44 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.58 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  45.56 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>