More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2480 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
346 aa  688    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  49.86 
 
 
369 aa  326  5e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  51.01 
 
 
390 aa  325  9e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  52.6 
 
 
375 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  47.4 
 
 
376 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  46.24 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  47.37 
 
 
309 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  40.83 
 
 
371 aa  238  9e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  39.71 
 
 
374 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
365 aa  198  9e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
361 aa  193  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
386 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
375 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 
370 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.12 
 
 
396 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
370 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  35.67 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  32.34 
 
 
366 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
399 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  41.8 
 
 
361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
368 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  33.2 
 
 
365 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  33.2 
 
 
365 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  33.2 
 
 
365 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
363 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.7 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  43.37 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.32 
 
 
415 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.92 
 
 
372 aa  126  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  37.76 
 
 
384 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
359 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
396 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  30.31 
 
 
379 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  29.47 
 
 
393 aa  122  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  28.52 
 
 
321 aa  122  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  39.81 
 
 
419 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
386 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  42.86 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.25 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
396 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 
356 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
346 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 
1032 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 
356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 
356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.46 
 
 
392 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.22 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.27 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.9 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.13 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.46 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.9 
 
 
420 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.9 
 
 
420 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.9 
 
 
420 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.62 
 
 
361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
356 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
361 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
361 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
375 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
365 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
361 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.17 
 
 
374 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
409 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
361 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
361 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
361 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
439 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
418 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  37.43 
 
 
374 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0191  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
364 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  41.73 
 
 
368 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  32.2 
 
 
399 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
381 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
361 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
365 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 
357 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
398 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
381 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
377 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 
365 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
379 aa  99.4  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
353 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
385 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.94 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0187  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
376 aa  96.7  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
361 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.56 
 
 
465 aa  95.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  33.04 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>