More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1478 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  100 
 
 
325 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  50.16 
 
 
329 aa  311  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
352 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
398 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
305 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
305 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
321 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
316 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
344 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.97 
 
 
312 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 
324 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 
280 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
302 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
318 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
330 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.7 
 
 
295 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
310 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
373 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
313 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.59 
 
 
321 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
320 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
597 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
289 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
581 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
337 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
299 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
235 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
318 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
347 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 
672 aa  96.3  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
374 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  31.12 
 
 
332 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
302 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
307 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
268 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.31 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  28.94 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.51 
 
 
310 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  43.36 
 
 
250 aa  89.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
358 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
360 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.2 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
326 aa  89.4  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.21 
 
 
326 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.07 
 
 
326 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
386 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.93 
 
 
326 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
316 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  27.94 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
230 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
155 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
397 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
1035 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
663 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
1152 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
233 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
1152 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
727 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.23 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.29 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.23 
 
 
266 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  39.23 
 
 
266 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
625 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4308  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
641 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2388  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
332 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.416344  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.23 
 
 
266 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  29.35 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
1067 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  40.5 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  41.58 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
544 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>