More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1306 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  34.4 
 
 		 294 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 244 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  25.63 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.66 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 		 235 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 663 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 		 390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  43.55 
 
 		 326 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 		 581 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 1035 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  26.97 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40.16 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.79 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.14 
 
 		 326 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  39.34 
 
 		 326 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 398 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.06 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.33 
 
 		 324 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 347 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 318 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 233 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  24.76 
 
 		 327 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 361 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 305 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 334 aa  96.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 344 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 386 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 333 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 384 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 380 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  31.36 
 
 		 321 aa  93.2  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 347 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 353 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 390 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 358 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  24.68 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 325 aa  89.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 1177 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 1177 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 363 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  27.49 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 350 aa  89.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 373 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  38.24 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  30.59 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  42.15 
 
 		 746 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.67 
 
 		 367 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 727 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 367 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  29.95 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  37.86 
 
 		 708 aa  86.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.39 
 
 		 350 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 		 337 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 299 aa  85.5  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  30.41 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>