More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2105 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
254 aa  531  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  45.38 
 
 
249 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  43.1 
 
 
250 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 
249 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  39.33 
 
 
244 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.76 
 
 
266 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.76 
 
 
266 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  39.76 
 
 
266 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.84 
 
 
266 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.16 
 
 
266 aa  168  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.4 
 
 
266 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.33 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  38.19 
 
 
290 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.8 
 
 
253 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0676  teichuronic acid biosynthesis  34.84 
 
 
285 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00829519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
255 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
256 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 
264 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
247 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  34.52 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2353  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
252 aa  121  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.712246  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
398 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
663 aa  111  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
327 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.99 
 
 
341 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  43.1 
 
 
146 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
321 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
597 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
333 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
330 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.36 
 
 
321 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  48.48 
 
 
102 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 
305 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40.52 
 
 
326 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.07 
 
 
321 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.16 
 
 
295 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 
344 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  39.66 
 
 
326 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  39.66 
 
 
326 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
274 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.18 
 
 
324 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  42.24 
 
 
326 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
361 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 
336 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
310 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
325 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
314 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  29.65 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
357 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
337 aa  99  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
358 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
347 aa  98.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
373 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.44 
 
 
672 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
280 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
351 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
347 aa  96.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
277 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
344 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
727 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
373 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 
1032 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
390 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
318 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
581 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
326 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
311 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
380 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
1035 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
302 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
333 aa  92  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
209 aa  92.4  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
319 aa  92  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  41.82 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.47 
 
 
327 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 
303 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
1250 aa  91.7  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
374 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36001  predicted protein  38.46 
 
 
424 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0387347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.3 
 
 
851 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
372 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
353 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.3 
 
 
851 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.3 
 
 
851 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.3 
 
 
851 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  34.3 
 
 
851 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>