More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3408 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
323 aa  676    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
376 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
321 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
321 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  40.16 
 
 
330 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
663 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.09 
 
 
321 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
329 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
329 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
338 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  32.43 
 
 
302 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
363 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
287 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
280 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
276 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
316 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
330 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
247 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.99 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
358 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
1250 aa  99.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
347 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
377 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
727 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  41.73 
 
 
269 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
289 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.26 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 
266 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  27.27 
 
 
340 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.38 
 
 
266 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.38 
 
 
266 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  28.38 
 
 
266 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
342 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
264 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  32.08 
 
 
249 aa  94  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.71 
 
 
312 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12951  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.52 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00175067  normal  0.0957676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.95 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
324 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
361 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
760 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3932  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 
302 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.13 
 
 
254 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
274 aa  89.7  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
320 aa  89.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
250 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
326 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
336 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
277 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.88 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.91 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
252 aa  87.4  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
349 aa  86.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 
347 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
316 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
324 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
398 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 
285 aa  86.7  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  27.36 
 
 
333 aa  86.3  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
295 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
294 aa  85.9  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  29.91 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 
296 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.64 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  33.86 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.76 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
246 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.44 
 
 
326 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>