More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4535 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 760 aa  1497    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 		 354 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 		 476 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 		 476 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  43.67 
 
 		 418 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  40.16 
 
 		 399 aa  156  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 340 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  41.92 
 
 		 325 aa  150  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4593  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 		 344 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  33.64 
 
 		 331 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 309 aa  145  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 337 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 		 335 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 		 324 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 342 aa  127  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  35.53 
 
 		 341 aa  114  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 		 358 aa  113  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  35.96 
 
 		 409 aa  111  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  37.33 
 
 		 264 aa  109  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 384 aa  108  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 		 366 aa  108  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 400 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.85 
 
 		 367 aa  108  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 		 294 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  30.65 
 
 		 672 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  26.92 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0792  hypothetical protein  36.04 
 
 		 673 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114506  normal  0.0948415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1690  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 518 aa  102  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0342764  hitchhiker  0.00101578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1970  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 318 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0816674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1692  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 518 aa  102  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 341 aa  100  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0832  hypothetical protein  35.4 
 
 		 673 aa  100  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0755  hypothetical protein  36.49 
 
 		 696 aa  100  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137164  normal  0.184305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  39.65 
 
 		 329 aa  99  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 403 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 365 aa  98.2  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 333 aa  97.8  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4525  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 337 aa  97.8  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.070536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 341 aa  97.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2552  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 318 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 		 1340 aa  97.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1214  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 632 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 274 aa  96.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1211  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 318 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.476178  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 		 348 aa  95.5  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  32.13 
 
 		 941 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 373 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5934  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  27.53 
 
 		 338 aa  95.1  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 499 aa  95.1  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  35.58 
 
 		 442 aa  95.1  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0314  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 		 323 aa  94.4  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.06758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.21 
 
 		 326 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 		 342 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  31.03 
 
 		 354 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  30.67 
 
 		 272 aa  92.8  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 334 aa  92.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  38.24 
 
 		 309 aa  92.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  27.09 
 
 		 413 aa  92  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 455 aa  92  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 609 aa  90.9  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 335 aa  90.9  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 261 aa  90.9  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 323 aa  90.5  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 351 aa  90.9  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 347 aa  90.1  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2081  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 520 aa  90.1  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312551  normal  0.0895678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 		 727 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 326 aa  89.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  32.26 
 
 		 260 aa  89  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 330 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.59 
 
 		 1157 aa  89  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.33 
 
 		 328 aa  89  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 337 aa  89  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 300 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.54 
 
 		 326 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 300 aa  88.6  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  28.8 
 
 		 358 aa  88.2  5e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 376 aa  88.2  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 349 aa  88.2  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 390 aa  88.2  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 398 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 306 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  29.65 
 
 		 327 aa  87.8  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 332 aa  87.8  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 		 305 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  40.78 
 
 		 374 aa  87.4  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  27.63 
 
 		 326 aa  87.4  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 		 397 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27900  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  47.75 
 
 		 1157 aa  87  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 		 322 aa  87  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 597 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  26.23 
 
 		 301 aa  87  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  31.6 
 
 		 637 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4601  glycosyl transferase family protein  34.84 
 
 		 341 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 347 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 		 394 aa  86.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0348  glycosyl transferase family 2  42 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 316 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 280 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.43 
 
 		 326 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>