173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0568 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  774    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  30.21 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
403 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  40.33 
 
 
371 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
402 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
274 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
360 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 
1340 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  30.06 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  27.27 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  44.12 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
432 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  24.44 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
402 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  38.01 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  32.8 
 
 
442 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
410 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
410 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  27.89 
 
 
402 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
421 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  31.8 
 
 
405 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
405 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  38.95 
 
 
408 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  28.82 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
400 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  31.88 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  37.57 
 
 
760 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
404 aa  87  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
405 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
388 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  26.5 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  40.77 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  40.77 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  29.21 
 
 
1119 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
994 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  25.27 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
703 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
433 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  26.55 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  36.52 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.8 
 
 
700 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  30.94 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
499 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  38.95 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  33.94 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  29.02 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  33.04 
 
 
409 aa  69.7  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.36 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
1106 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.59 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
956 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  27.27 
 
 
420 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  21.88 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  24.39 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  21.2 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
1152 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  32.95 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
410 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  21.8 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  30.63 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  29.81 
 
 
429 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>