More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3796 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
387 aa  786    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
403 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
410 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
389 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
411 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
402 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 
402 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
956 aa  123  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  27.16 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  27.78 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  32.36 
 
 
402 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  27.36 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 
1119 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  31.61 
 
 
402 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
436 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
418 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
396 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
1340 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 
405 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  38.98 
 
 
416 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
409 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  31.28 
 
 
860 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 
499 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
417 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
405 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
417 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  29.43 
 
 
404 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
399 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
399 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
412 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
422 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
994 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
1156 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 
402 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
435 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  27 
 
 
420 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  24.69 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  31.37 
 
 
443 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
1106 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
703 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
443 aa  92.8  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  31.14 
 
 
402 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  31.82 
 
 
405 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  35.78 
 
 
394 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  31.56 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
413 aa  89.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
397 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
406 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
824 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  29.75 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  38.22 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  26.17 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  24.26 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  30.77 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  38.75 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
902 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.75 
 
 
700 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
435 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  31.64 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  33.94 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  29.28 
 
 
537 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
535 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  42.62 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>