138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1794 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  83.05 
 
 
419 aa  742    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
419 aa  879    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  57.56 
 
 
419 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  55.8 
 
 
410 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  52.72 
 
 
429 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  49.51 
 
 
414 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  51.49 
 
 
407 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  52.27 
 
 
402 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  44.15 
 
 
410 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  46.98 
 
 
423 aa  378  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  30.59 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
1340 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 
994 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
703 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
956 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
535 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  28.22 
 
 
443 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  35.02 
 
 
700 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  26.07 
 
 
1119 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
902 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
1156 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
499 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
1106 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.65 
 
 
860 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  37.67 
 
 
402 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  24.4 
 
 
537 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
274 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
691 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
691 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  31.85 
 
 
442 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
389 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
691 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  23.75 
 
 
537 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  25.81 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
824 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  26.18 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
683 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
360 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  28.74 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.03 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 
892 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  31.65 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  30.22 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  28.99 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  28.57 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
416 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  23.63 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  25.09 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
1152 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  27.12 
 
 
402 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  23.28 
 
 
402 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.54 
 
 
429 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  27.12 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
760 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
418 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  33.93 
 
 
394 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
374 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 
406 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  21.66 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  25.71 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>