More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0831 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  91.03 
 
 		 691 aa  1191    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  98.26 
 
 		 691 aa  1353    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  52.49 
 
 		 683 aa  734    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 691 aa  1373    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 		 824 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 892 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  41.71 
 
 		 1837 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 		 1152 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  35.28 
 
 		 1075 aa  319  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 1340 aa  292  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 		 995 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 703 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 700 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 994 aa  243  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 1106 aa  211  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 		 902 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  25.97 
 
 		 860 aa  196  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 1077 aa  143  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 456 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  38.86 
 
 		 1739 aa  133  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  34.29 
 
 		 2401 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  30.91 
 
 		 443 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 		 775 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 535 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 329 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 334 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  25 
 
 		 1119 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 		 710 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.6 
 
 		 1644 aa  114  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.6 
 
 		 1644 aa  114  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 340 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 717 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 		 721 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 956 aa  111  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 729 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 324 aa  110  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  34 
 
 		 717 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 		 298 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 324 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  33.43 
 
 		 557 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 		 312 aa  104  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 290 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 617 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 785 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 1267 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 		 340 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 336 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 988 aa  101  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 		 304 aa  101  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 311 aa  101  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 602 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 624 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  36.86 
 
 		 310 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 		 1334 aa  100  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 1267 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 		 334 aa  99.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 378 aa  99  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 728 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  28.19 
 
 		 537 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 		 319 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 324 aa  97.4  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 312 aa  97.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 832 aa  97.1  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 		 274 aa  97.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 289 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 635 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4710  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 749 aa  95.1  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.436323  normal  0.224848 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 		 324 aa  95.1  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 679 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 1523 aa  94.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 333 aa  94.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 319 aa  94  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 662 aa  94  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 307 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.5 
 
 		 427 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 308 aa  93.2  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 		 753 aa  93.6  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 808 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 360 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 310 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  32.76 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 		 723 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  29.46 
 
 		 419 aa  92.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 314 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 709 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 709 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 273 aa  92  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 1523 aa  91.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 		 714 aa  91.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 		 1162 aa  91.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 298 aa  91.3  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>