More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2000 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 403 aa  834    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  37.68 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  32.65 
 
 		 414 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 432 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 		 274 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 412 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.56 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 407 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  29.33 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  29.09 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.93 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 414 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  27.92 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.32 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 409 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  23.38 
 
 		 397 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  28 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  27.16 
 
 		 399 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 405 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 410 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 		 1340 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  27.34 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 		 956 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  27.91 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 703 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 499 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 1156 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  26.91 
 
 		 402 aa  99.8  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  23.08 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 994 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  25.51 
 
 		 1119 aa  96.3  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  21.79 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  31.34 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 435 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 		 410 aa  86.3  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 1106 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0654  glycosyltransferase  24.8 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.385446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 824 aa  80.1  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  26.69 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  27.54 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.83 
 
 		 860 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  23.18 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>