196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0784 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  75.82 
 
 
371 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  39.79 
 
 
414 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  32.6 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  42.48 
 
 
416 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  43.37 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  40.96 
 
 
418 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 
274 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 
435 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
402 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
408 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
409 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
417 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  25.75 
 
 
397 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 
417 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  36.22 
 
 
442 aa  97.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 
402 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
410 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  40.58 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  32.72 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  26.82 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
1340 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
405 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 
435 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
389 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  29.52 
 
 
414 aa  89.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
415 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
956 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  35.67 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
402 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
396 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  25.9 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
414 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
411 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
405 aa  87  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  31.25 
 
 
402 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  31.06 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  27.06 
 
 
1119 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  43.42 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  30.17 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0563  hypothetical protein  24.13 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  37.41 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  35.82 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
691 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1248  putative mannosyltransferase WbyJ  20.76 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000203407  decreased coverage  7.99612e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
1156 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  34.17 
 
 
700 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3044  putative mannosyltransferase WbyJ  20.76 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.681162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
691 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
703 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  37.59 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  25.22 
 
 
396 aa  77  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  42.2 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  36.31 
 
 
691 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
1106 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  32.47 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  31.25 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  31.03 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  29.49 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  40.15 
 
 
760 aa  69.7  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  35.71 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  32.73 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>