More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1626 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  79.24 
 
 
436 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
434 aa  872    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  49.88 
 
 
407 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
274 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  25.89 
 
 
396 aa  153  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
421 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
404 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
432 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
403 aa  146  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  30.97 
 
 
402 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
410 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
418 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  29.95 
 
 
402 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  29.33 
 
 
405 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  24.07 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  28.93 
 
 
413 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  28.64 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  40.96 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
416 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  24.94 
 
 
414 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
387 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  30.86 
 
 
399 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
402 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
402 aa  123  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
392 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  39.34 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
399 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
399 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 
429 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  42.49 
 
 
429 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
406 aa  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
404 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
389 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  41.58 
 
 
401 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 
422 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  30.58 
 
 
399 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
417 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
417 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
408 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  29.81 
 
 
394 aa  107  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
456 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  32.14 
 
 
402 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 
413 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
703 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
399 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 
396 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  27.8 
 
 
402 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
411 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 
406 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
410 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
535 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  22.03 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
442 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  29.59 
 
 
1119 aa  94.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
1340 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
1156 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
956 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
499 aa  86.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  21.58 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
994 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
902 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  21.64 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  25.68 
 
 
860 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  31.21 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  22.56 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1106 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  37.1 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  32.33 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  29.59 
 
 
700 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  37.01 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.58 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
468 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>