134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2880 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 391 aa  798    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 402 aa  93.2  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  40.94 
 
 		 401 aa  92.8  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  39.85 
 
 		 417 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.34 
 
 		 413 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 274 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  31.3 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 371 aa  87  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 409 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  35.71 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  23.24 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 		 468 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  28.89 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.4 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  41.07 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  25.47 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  25.23 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 703 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  25.15 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  22.82 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 956 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  28.22 
 
 		 1119 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 		 1340 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  39.64 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  32.98 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 		 1156 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  25.34 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  24.66 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  24.05 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  33.86 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  32.79 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  25.2 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  27.71 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  25.95 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  28.36 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 1106 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  28.57 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22.14 
 
 		 994 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  29.63 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  28.65 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  30.2 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  36.19 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  29.73 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  24.2 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  30.3 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  22.51 
 
 		 691 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  27.93 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  25.78 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  21.09 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  22.29 
 
 		 691 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.18 
 
 		 860 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>