More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3003 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  801    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  97.01 
 
 
402 aa  783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  64.85 
 
 
405 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  57.92 
 
 
405 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  58.66 
 
 
405 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  54.73 
 
 
415 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  54.48 
 
 
415 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  54.14 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  53.98 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
432 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
410 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 
421 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  36.61 
 
 
402 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
402 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
418 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
407 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
403 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
402 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
434 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  23.76 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
404 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  30.07 
 
 
413 aa  126  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
389 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  26.57 
 
 
399 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  24.46 
 
 
414 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  22.93 
 
 
396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  35.71 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
499 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
387 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
408 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
1340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
406 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.98 
 
 
429 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 
443 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  36.49 
 
 
443 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
360 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
417 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  24.68 
 
 
402 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
417 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
417 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
417 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  20.59 
 
 
400 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
429 aa  96.3  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
703 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
1156 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  34.97 
 
 
700 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
956 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2352  hypothetical protein  28.38 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
413 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
535 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  26.99 
 
 
402 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
412 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 
388 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.51 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.91 
 
 
860 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
456 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
394 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  31.25 
 
 
408 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  25 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  24.36 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  25.44 
 
 
1119 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.42 
 
 
1106 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  20.96 
 
 
994 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  30.86 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  30.3 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  29.26 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  26.23 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  30.87 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>