More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1308 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 399 aa  795    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  26.75 
 
 		 793 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 1348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  33.91 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  22.17 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 		 1340 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  22.71 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  22.07 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  21.78 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  29.27 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3256  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1199 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  27.65 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  25.98 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  28.52 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  23.27 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  22.91 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2865  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1199 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.739863  decreased coverage  0.00031468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  22.69 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 		 703 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  22.46 
 
 		 860 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  25.91 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2103  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  23.25 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 535 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.1 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  20.1 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 1156 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.29 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.85 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  21.68 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  21.68 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  26.75 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  27.15 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  21.29 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  26.19 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  20.99 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  21.67 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  26.04 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0201  glycosyl hydrolase domain-containing protein  23.3 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0179492  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  21.19 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  20.83 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  21.52 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  18.36 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>